Nytt nukleinsyredeteksjonssett for Coronavirus (SARS-Cov-2).
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Flumalmscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Product name 】Nytt Coronavirus(SARS-Cov-2) nukleinsyredeteksjonssett (fluorescerende RT-PCR-sondemetode)
【Packaging specifications 】25 tester/sett
【Intended usalder】
Dette settet brukes til kvalitativ påvisning av nukleinsyre fra nytt koronavirus i nasofaryngeale vattpinner, orofaryngeale (hals) vattpinner, fremre nasale vattpinner, mid-turbinate vattpinner, neseskyllinger og nasale aspirater fra personer som er mistenkt for COVID19 av helsepersonell. Påvisningen av ORF1ab- og N-gener til det nye koronaviruset kan brukes til hjelpediagnose og epidemiologisk overvåking av ny koronavirusinfeksjon.
【Principles of the procedure 】
Dette settet er designet for spesifikke TaqMan-prober og spesifikke primere designet for de nye koronaviruset (SARS-Cov-2) ORF1ab og N-gensekvensene. PCR-reaksjonsløsningen inneholder 3 sett med spesifikke primere og fluorescerende prober for spesifikk påvisning av mål, og et ekstra sett med spesifikke primere og fluorescerende prober brukes som intern standardkontroll av settet for påvisning av endogene husholdningsgener.
Testprinsippet er at den spesifikke fluorescerende proben fordøyes og brytes ned av eksonukleaseaktiviteten til Taq-enzymet i PCR-reaksjonen, slik at reporterfluorescensgruppen og den slukkede fluorescerende gruppen separeres, slik at fluorescensovervåkingssystemet kan motta en fluorescerende signal, og deretter Gjennom berikelseseffekten av PCR-amplifikasjon, når fluorescenssignalet til proben en satt terskelverdi-Ct-verdi (syklusterskel). I tilfellet av ingen målamplikon, er reportergruppen til sonden nær quenching-gruppen. På dette tidspunktet skjer overføringen av fluorescensresonansenergi, og fluorescensen til reportergruppen stanses av quenching-gruppen, slik at det fluorescerende signalet ikke kan detekteres av det fluorescerende PCR-instrumentet.
For å overvåke bruken av reagenser under testen, er settet utstyrt med positive og negative kontroller: den positive kontrollen inneholder målstedets rekombinante plasmid, og den negative kontrollen er destillert vann, som brukes til å overvåke miljøforurensning. Det anbefales å sette en positiv kontroll og en negativ kontroll samtidig ved testing.
【Main components 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | Components | |
Name | Spesifikasjon | Quantity | Quantity | |
Positiv kontroll | 180 μL/hetteglass | 1 | 1 | Kunstig konstruerte plasmider, destillert vann |
Negativ kontroll | 180 μL/hetteglass | 1 | 1 | Destillert vann |
SARS-Cov-2-blanding | 358,5 μL/hetteglass | 1 | / | Spesifikke primerpar, spesifikke deteksjonsfluorescerende prober, dNTP-er, , MgCl2, KCl, Tris-Hcl, destillert vann, etc. |
Enzymblanding | 16,5 μL/hetteglass | 1 | / | Taq-enzymer, revers transkriptase, UNG-enzymer, etc. |
SARS-Cov-2-blanding (lyofilisert) | 25 tester/hetteglass | / | 1 | Spesifikke primerpar, spesifikke deteksjonsfluorescerende prober, dNTP-er, Taq-enzymer, revers transkriptase, destillert vann, etc. |
2x buffer | 375 μL/hetteglass | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, destillert vann, etc. |
Note:(1) Komponentene i forskjellige batchsett kan ikke blandes eller byttes ut.
(2) Forbered ditt eget reagens: Nukleinsyreekstraksjonssett.
【Storage conditions og expiration date 】
For BST-SARS-25:Transporter og lagre ved -20±5 ℃ i lang tid.
For BST-SARS-DR-25:Transport ved romtemperatur. Oppbevares ved -20±5 ℃ i lang tid.
Unngå gjentatte fryse-tine-sykluser. Gyldighetsperioden er foreløpig satt til 12 måneder.
Se etiketten for produksjons- og bruksdato.
Etter første åpning kan reagensen oppbevares ved -20±5 °C i ikke mer enn 1 måned eller til slutten av reagensperioden, avhengig av hvilken dato som kommer først, for å unngå gjentatte frys-tine-sykluser og antall reagensfrysing -tiningssykluser bør ikke overstige 6 ganger.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1.Gjeldende prøvetype: Ekstrahert nukleinsyreløsning.
2. Oppbevaring og transport av prøver: Oppbevares ved -20±5 ℃ i 6 måneder. Frys og tin prøvene ikke mer enn 6 ganger.
【Tanslåtting method】
1.Nucleic acid extraction
Velg et passende nukleinsyreekstraksjonssett for å ekstrahere viral nukleinsyre, og følg de tilsvarende settinstruksjonene. Det anbefales å bruke et nukleinsyreekstraksjons- og rensesett produsert av Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. eller tilsvarende nukleinsyrerensesett.
2. Reaction reagent preparation
2.1 For BST-SARS-25:
(1) Fjern SARS-Cov-2-blandingen og enzymblandingen, smelt fullstendig ved romtemperatur, bland grundig med Vortex-enhet og sentrifuger deretter kort.
(2) 16,5 uL Enzyme Mix ble tilsatt til 358,5 uL SARS-Cov-2 Mix og blandet grundig for å oppnå den blandede reaksjonsløsningen.
(3) Klargjør et rent 0,2 mL PCR oktalrør og merk det med 15uL av den ovenfor blandede reaksjonsløsningen per brønn.
(4) Tilsett 15 μL renset nukleinsyreløsning, den positive kontrollen og den negative kontrollen, og dekk forsiktig til det oktale røret.
(5) Bland godt ved å snu opp ned, og sentrifuger raskt for å konsentrere væsken i bunnen av røret.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
( 1) Tilsett 375 ul 2x buffer til SARS-Cov-2 Mix((lyofilisert) for å forberede reaksjonsblandingen. Bland grundig ved pipettering og sentrifuger deretter kort. (Når reaksjonsblandingen er klargjort, anbefales det å lagre ved -20 ℃ ved langtidslagring.)
(2) Forbered et rent 0,2 mL PCR oktalrør og merk det med 15 μL reaksjonsblanding per brønn.
(3) Tilsett 15 μL renset nukleinsyreløsning, den positive kontrollen og den negative kontrollen, og dekk forsiktig til det oktale røret.
(4) Bland godt ved å snu opp ned, og sentrifuger raskt for å konsentrere væsken i bunnen av røret.
3. PCR amplification (Se instrumenthåndboken for driftsinnstillinger.)
3. 1 Plasser PCR 8-røret i prøvekammeret til det fluorescerende PCR-instrumentet, og still inn prøven som skal testes, den positive kontrollen og den negative kontrollen i henhold til rekkefølgen av lasting.
3.2 Fluorescensdeteksjonskanal:
(1) ORF1ab-genet velger deteksjonskanalen til FAM (Reporter: FAM, Quencher: Ingen).
(2) N-genet velger deteksjonskanalen til VIC (Reporter: VIC, Quencher: Ingen).
(3) Internt standardgen velger deteksjonskanalen til CY5 (Reporter: CY5, Quencher: Ingen).
(4) Den passive referansen er satt til ROX.
3.3 Innstilling av PCR-programparameter:
Skritt | Temperatur (℃) | Tid | Antall sykluser | |
1 | Omvendt transkripsjonsreaksjon | 50 | 15 min | 1 |
2 | Taq enzymaktivering | 95 | 2,5 min | 1 |
3 | Taq enzymaktivering | 93 | 10 s | 43 |
Utglødningsforlengelse og fluorescensopptak | 55 | 30 s |
Etter innstillingen lagrer du filen og kjører reaksjonsprogrammet.
4.Results analysis
Etter at programmet er avsluttet, lagres resultatene automatisk, og amplifikasjonskurven analyseres. Amplifikasjonskurven er satt til instrumentets standardterskel.
【Explanation of test results 】
1. Bestem eksperimentets gyldighet: Den positive kontrollen FAM, VIC-kanalen skal ha en typisk amplifikasjonskurve, og Ct-verdien er generelt mindre enn 34, men kan variere på grunn av ulike terskelinnstillinger for ulike instrumenter. Den negative kontrollen FAM, VIC-kanalen skal være ikke-forsterket Ct. Det er enighet om at ovennevnte krav samtidig skal oppfylles, ellers er denne testen ugyldig.
2. Resultatvurdering
FAM/VIC-kanal | Domsresultat |
Ct<37 | Prøveprøven er positiv |
37≤Ct<40 | Amplifikasjonskurven er S-formet, og mistenkelige prøver må undersøkes på nytt; hvis omprøveresultatene er konsistente, vurderes det som positivt, ellers er det negativt |
Ct≥40 eller ingen forsterkning | Prøvetesten er negativ (eller under den nedre grensen for settdeteksjon) |
Merk: ( 1) Hvis både FAM-kanalen og VIC-kanalen er positive samtidig, er SARS-Cov-2 bestemt til å være positiv.
(2) Hvis FAM-kanalen eller VIC-kanalen er positiv og den andre kanalen er negativ, bør testen gjentas. Hvis det er positivt samtidig, vil det bli vurdert som SARS-Cov-2 positivt, ellers vil det bli vurdert som SARS-Cov-2 negativt.